由于總面積是一定的，而許多第三方物流企業(yè)在建造自動化立體倉庫時只重視辦公、實驗(包括研發(fā))的面積，卻忽視了庫房面積，因此造成了這種局面，即為了滿足庫容量的需要，只好通過向空間發(fā)展來達到要求。但是貨架越高，機械設備的采購成本和運行成本也就越高。除此之外，由于自動化立體倉庫內優(yōu)的物流路線是直線形的，但在倉庫設計時往往會受到平面面積的限制，造成本身物流路線的迂回(往往是s形，甚至是網狀)，這會增加許多不必要的投入和麻煩。

不管自動化立體倉庫的自動化程度有多高，具體運作時仍需要一定的人工勞動，因此工作人員的數量要合適。人員不足會降低倉庫的效率，太多又會造成浪費。自動化立體倉庫采用了大量的設備，因此對人員的素質要求比較高，人員素質跟不上，同樣會降低倉庫的吞吐能力。第三方物流企業(yè)需要招聘的人才，并對其進行的培訓。

由于數據傳輸路徑不通暢或數據冗余等原因，會造成系統(tǒng)數據傳輸速度慢，甚至無法傳輸的現象，因此要考慮自動化立體倉庫內部以及與第三方物流企業(yè)上下級管理系統(tǒng)間的信息傳遞的問題。

隨著經濟全球化步伐的加快，物流供應鏈中蘊藏的潛力越來越引起人們的注意。而物流中心則是物流供應鏈中重要的樞紐之一。它是接受并處理下游用戶的訂貨信息，對上游供應方的大批量貨物進行集中儲存、加工等作業(yè)，并向下游進行批量轉運的設施和機構。而實現這些功能的直接執(zhí)行機構包括：
（1） 自動倉儲設備（自動化立體倉庫）
（2） 其它貨架（平面托盤貨架與流動貨架等）
（3） 各種輸送機（輥道輸送機、鏈條輸送機、皮帶輸送機、升降移載機、提升機等）
（4） 各種分揀設備
（5） 無人臺車（AGV、RGV、LGV）
（6） 其它各種輔助設備

作為物流中心的重要組成部分，自動化立體倉庫（Automatic Storage & Retrieval System）直接影響到企業(yè)制定的戰(zhàn)略和計劃、指揮和調整企業(yè)的行動。這里，簡單談一下它的設計步驟，一般分為以下幾步：
一、收集、研究用戶的原始資料，明確用戶所要達到的目標，這些原始資料包括：
1、明確自動化立體倉庫與上游、下游銜接的工藝過程，
2、物流要求：上游進入倉庫的大入庫量、向下游轉運的大出庫量以及所要求的庫容量；
3、物料的規(guī)格參數：物料的品種數、物料包裝形式、外包裝尺寸、重量、保存方式及其它物料的其它特性；
4、立體倉庫的現場條件及環(huán)境要求；
5、用戶對倉庫管理系統(tǒng)的功能要求；
6、其它相關的資料及特殊要求。
自動化立體倉庫可以形成的生產鏈，促進了生產力的進步。人士指出，由于自動化立體倉庫的存取，因此可以有效地連接倉庫外地生產環(huán)節(jié)，可以在存儲中形成自動化的物流系統(tǒng)，從而形成有計劃有編排的生產鏈，使生產能力得到了大幅度的提升。